In dit hoofdstuk worden de belangrijkste structurele kenmerken, de geordende indeling en de naamgeving (ofwel taxonomie) van pathogene micro-organismen besproken en ook enkele relevante fysiologische aspecten. Achtereenvolgens komen de volgende ziekteverwekkers aan bod: de virussen, bacteriën, fungi (die kunnen aangetroffen worden als gist of als schimmelvorm met vertakkende hyfen) en parasieten (ectoparasieten en endoparasieten). Endoparasieten kunnen onderverdeeld worden in eencellige organismen (protozoën) en de meercellige wormen (helminthen). Wormen worden ingedeeld in platwormen (Plathyhelminthes), waaronder de lintwormen (Cestoda) en zuigwormen (Trematoda), en de rondwormen (nematoden).